Directorio
José Antonio Pedroza García
Correo: joped@quimica.unam.mx
Licenciatura Químico Farmacéutico Biólogo, Facultad de Química, UNAM (2006-2010).
Maestría en Ciencias Bioquímicas. Facultad de Química, UNAM (2011-2013).
Doctorado en Biología Molecular de Plantas. Université Paris-Saclay (Université Paris Sud XI), París, Francia (2013-2016).
Posdoctorado en el Instituto de Ecología, UNAM (2017).
Posdoctorado en Flemish Institute for Biotechnology (VIB-UGent Center for Plant Systems Biology), Ghent University, Bélgica (2018-2020).
Posdoctorado en el Instituto de Biotecnología UNAM (2021-2022).
[L] Curso de Bioquímica General (Licenciaturas de Q, QIM e iQ, Facultad de Química, UNAM)
[L] Curso de Bioquímica Experimental (Licenciatura de QFB, Facultad de Química, UNAM)
[Pg] Biología Molecular (módulo de Técnicas de DNA recombinante), Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM
- Integridad genómica en plantas
- Respuesta al daño al DNA
- Mecanismos de reparación del daño al DNA
- Estrés abiótico
- Ingeniería genética en plantas
- Estudio de las vías de señalización de la respuesta a daño al DNA para mantener la integridad del DNA en núcleo, cloroplastos y mitocondria.
- Caracterización de novedosos actores involucrados en mecanismos de reparación del daño al DNA de cloroplasto y mitocondria. A nivel bioquímico (in vitro) y usando plantas modificadas genéticamente (in vivo).
- Estudio del mantenimiento del nicho de células troncales en plantas en respuesta a daño al DNA.
- Diseño y Bioingeniería de estrategias biotecnológicas para el mejoramiento de la resiliencia de plantas en respuesta a diferentes tipos de estrés ambiental.
Uno de los principales retos en la actualidad es la pérdida de productividad en plantas de interés agronómico debido al cambio climático. Las plantas están expuestas continuamente a condiciones adversas presentes en su medio ambiente, las cuales pueden inducir daño sobre el DNA, mermando la estabilidad de su genoma lo que podría afectar el crecimiento y su supervivencia. Por su estilo de vida inmóvil las plantas se exponen a agentes que generan daño directamente como altas dosis de radiación UV y elevadas concentraciones de metales pesados en suelos contaminados. Sin embargo, otros tipos de estrés ambiental como frío, altas temperaturas, sequía y alta salinidad provocan acumulación directa de especies reactivas de oxígeno (ROS), las cuales pueden reaccionar con el DNA provocando alteraciones químicas sobre este. Para hacer frente a lesiones severas en el DNA, redes celulares altamente coordinadas son activadas las cuales son colectivamente denominadas respuesta al daño del DNA (DNA Damage Response, DDR), la activación de estos mecanismos es esencial para evitar acumulación de mutaciones. A diferencia de otros eucariotas estos mecanismos moleculares son pocos comprendidos en plantas, las líneas de investigación del laboratorio están enfocadas en mejorar nuestra comprensión acerca de los mecanismos que contribuyen a salvaguardar la integridad del DNA en núcleo, cloroplastos y mitocondrias. Se espera que el conocimiento básico generado se utilicé para desarrollar novedosas estrategias biotecnológicas para mejorar la respuesta a estrés ambiental tanto en la planta modelo Arabidopsis thaliana como en tomate (Solanum lycopersicum).
- Posgrado en Ciencias Bioquímicas, UNAM
- Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores Nivel 1 (2023-2027)– CONACyT
- Mención Honorífica en la obtención del grado de licenciatura. Facultad de Química, UNAM
- Mención Honorífica en la obtención del grado de maestría en Ciencias Bioquímicas. Facultad de Química, UNAM
- Beca doctoral otorgada por la Université Paris-Sud XI (2013-2016)
- Postdoctoral Grant by Vlaams Instituut voor Biotechnologie, VIB. Ghent University, Belgium (2018-2020)
- Beca posdoctoral DGAPA-UNAM (2021-2022)
Nisa, M., Eekhout, T., Bergis, C., Pedroza-García, J. A., He, X., Mazubert, C., Vercauteren, I., Cools, T., Brik-Chaouche, R., Drouin-Wahbi, J., Chmaiss, L., Latrasse, D., Bergounioux, C., Vandepoele, K., Benhamed, M., De Veylder, L., & Raynaud, C.* (2023). Distinctive and complementary roles of E2F transcription factors during plant replication stress responses. Molecular Plant, 16(8), 1269-1282.
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García-Gómez, M. L., Reyes-Hernández, B. J., Sahoo, D. P., Napsucialy-Mendivil, S., Quintana-Armas, A. X., Pedroza-García, J. A., Shishkova, S., Torres-Martínez, H. H., Pacheco-Escobedo, M. A., & Dubrovsky, J. G.* (2022). A mutation in THREONINE SYNTHASE 1 uncouples proliferation and transition domains of the root apical meristem: experimental evidence and in silico proposed mechanism. Development, 149(21).
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Guzman-Chavez, F., Arce, A., Adhikari, A., Vadhin, S., Pedroza-Garcia, J. A., Gandini, C., Ajioka, J. W., Molloy, J., Sanchez-Nieto, S., Varner, J. D., Federici, F., & Haseloff, J.* (2022). Constructing Cell-Free Expression Systems for Low-Cost Access. ACS Synthetic Biology, 11(3), 1114-1128.
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Pedroza‐Garcia, J. A., Xiang, Y., & De Veylder, L.* (2021). Cell cycle checkpoint control in response to DNA damage by environmental stresses. The Plant Journal, 109(3), 490-507.
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García-Medel, P. L., Peralta-Castro, A., Baruch-Torres, N., Fuentes-Pascacio, A., Pedroza-García, J. A., Cruz-Ramirez, A., & Brieba, L. G.* (2021). Arabidopsis thaliana PrimPol is a primase and lesion bypass DNA polymerase with the biochemical characteristics to cope with DNA damage in the nucleus, mitochondria, and chloroplast. Scientific Reports, 11(1).
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Eekhout, T., Pedroza-Garcia, J. A., Kalhorzadeh, P., De Jaeger, G., & De Veylder, L.* (2021). A Mutation in DNA Polymerase α Rescues WEE1KO Sensitivity to HU. International Journal of Molecular Sciences, 22(17), 9409.
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Pedroza-Garcia, J. A., Eekhout, T., Achon, I., Nisa, M. U., Coussens, G., Vercauteren, I., Van den Daele, H., Pauwels, L., Van Lijsebettens, M., Raynaud, C., & De Veylder, L.* (2021). Maize ATR safeguards genome stability during kernel development to prevent early endosperm endocycle onset and cell death. The Plant Cell, 33(8), 2662-2684.
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Eekhout, T., Dvorackova, M., Pedroza Garcia, J. A., Nespor Dadejova, M., Kalhorzadeh, P., Van den Daele, H., Vercauteren, I., Fajkus, J., & De Veylder, L.* (2021). G2/M-checkpoint activation in fasciata1 rescues an aberrant S-phase checkpoint but causes genome instability. Plant Physiology, 186(4), 1893-1907.
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Willems, A., Heyman, J., Eekhout, T., Achon, I., Pedroza-Garcia, J. A., Zhu, T., Li, L., Vercauteren, I., Van den Daele, H., van de Cotte, B., De Smet, I., & De Veylder, L.* (2020). The Cyclin CYCA3;4 Is a Postprophase Target of the APC/CCCS52A2 E3-Ligase Controlling Formative Cell Divisions in Arabidopsis. The Plant Cell, 32(9), 2979-2996.
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Nájera-Martínez, M., Pedroza-García, J. A., Suzuri-Hernández, L. J., Mazubert, C., Drouin-Wahbi, J., Vázquez-Ramos, J., Raynaud, C., & Plasencia, J.* (2020). Maize Thymidine Kinase Activity Is Present throughout Plant Development and Its Heterologous Expression Confers Tolerance to an Organellar DNA-Damaging Agent. Plants, 9(8), 930.
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Pedroza-García, J. -., Nájera-Martínez, M., Mazubert, C., Aguilera-Alvarado, P., Drouin-Wahbi, J., Sánchez-Nieto, S., Gualberto, J.M., Raynaud, C.*, & Plasencia, J.* (2019). Role of pyrimidine salvage pathway in the maintenance of organellar and nuclear genome integrity. Plant Journal, 97(3), 430-446.
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Pedroza-García, J. A., Mazubert, C., del Olmo, I., Bourge, M., Domenichini, S., Bounon, R., Tariq, Z., Delannoy, E., Piñeiro, M., Jarillo, J. A., Bergounioux, C., Benhamed, M., & Raynaud, C. (2017). Function of the Plant DNA Polymerase Epsilon in Replicative Stress Sensing, a Genetic Analysis. Plant Physiology, 173(3), 1735-1749.
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Pedroza-Garcia, J. A., Domenichini, S., Bergounioux, C., Benhamed, M., & Raynaud, C.* (2016). Chloroplasts around the plant cell cycle. Current Opinion in Plant Biology, 34, 107-113.
DOI:10.1016/j.pbi.2016.10.009
Pedroza-Garcia, J. A., Domenichini, S., Mazubert, C., Bourge, M., White, C., Hudik, E., Bounon, R., Tariq, Z., Delannoy, E., del Olmo, I., Piñeiro, M., Jarillo, J. A., Bergounioux, C., Benhamed, M., & Raynaud, C.* (2016). Role of the Polymerase ϵ sub-unit DPB2 in DNA replication, cell cycle regulation and DNA damage response in Arabidopsis. Nucleic Acids Research, 44(15), 7251-7266.
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Pedroza-García, J. A., Nájera-Martínez, M., de la Paz Sanchez, M., & Plasencia, J.* (2015). Arabidopsis thaliana thymidine kinase 1a is ubiquitously expressed during development and contributes to confer tolerance to genotoxic stress. Plant Molecular Biology, 87(3), 303-315.
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